##gff-version 3 sequence1 MetaGeneAnnotator CDS 5718 6113 . - 0 ID=MGA_2;product=30S ribosomal protein S9;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_003549055.1;translation=MAQQAAYAGTGRRKNSVARVRLVPGNGKITVNKEDVTEYIPYPNLVKDLKQPLALTETEGQYDVIVNVNGGGFSGQAGAIRHGIARALLEVDPDFRGSLKKAGLLTRDPRMKERKKPGLKKARKASQFSKR;locus_tag=LOCUS_0010;gene=rpsI;note=WP_003549055.1 30S ribosomal protein S9 (Lactobacillus acidophilus) [pid:89.3%25%2C q_cov:100.0%25%2C s_cov:100.0%25%2C Eval:4.4e-62],MGA_2 sequence1 MetaGeneAnnotator CDS 6127 6675 . - 0 ID=MGA_3;product=50S ribosomal protein L13;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_003549054.1;translation=MTFAQKGRKLLIVCLSTIGPGNLLYVKHKKTEELKLRTTPLAKTSDIKRKWYVIDATDVALGRLSAAVATILRGKNKPQYTPNVDTGDNVIIINAAKLKLTGRKSTDKIYYHHSDYRGGLRATAAGELLANNPVRLVELSVKGMLPKNTLGHQEFLKMHVYAGEDHKHAAQKPETLDINKLI;locus_tag=LOCUS_0020;gene=rplM;note=WP_003549054.1 50S ribosomal protein L13 (Lactobacillus acidophilus) [pid:82.3%25%2C q_cov:80.8%25%2C s_cov:100.0%25%2C Eval:2.0e-69],MGA_3 sequence1 MetaGeneAnnotator CDS 6672 7454 . - 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0 ID=MGA_38;product=pur operon repressor;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_003548880.1;translation=MKRSERLVDMVQYLTTHPHTLISLPFFATRYDSAKSSISEDLAILRNTFAKYEIGILETVAGVAGGVRLIPFIGFNTAGDYLKQLADRIEDPERILPGNFIYLSDVLGDPQELRHVGELIATKYAYSNVDYVMTIETKGIAIANSVSRLLNVPYVLVRRRPKITEGATVSVNYVASSSDRVEKMELAKRSLPEGSNVLIVDDFMKGGGTLNGMEELTKEFKCHVVGMCVLCEASNPVNKVVDDYQTLVKITEVDRSKGIIKAKPGNLLEQIDFQKFPK;locus_tag=LOCUS_0370;gene=purR;note=WP_003548880.1 pur operon repressor (Lactobacillus acidophilus) [pid:63.4%25%2C q_cov:99.3%25%2C s_cov:100.0%25%2C Eval:2.2e-97],MGA_38 sequence1 MetaGeneAnnotator CDS 27390 27632 . - 0 ID=MGA_39;product=Veg family protein;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_003548879.1;translation=MPMSLMAIKEKLDNHLGQELIVIAQAGRKKVIRRKGVLKKTYPAVFVVDLDQQQNNFERVSYSYTDLLTKNIELDFDVIS;locus_tag=LOCUS_0380;note=WP_003548879.1 Veg family protein (Lactobacillus acidophilus) [pid:70.1%25%2C q_cov:96.2%25%2C s_cov:90.6%25%2C Eval:6.0e-27],MGA_39 sequence1 MetaGeneAnnotator CDS 27710 28597 . - 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0 ID=MGA_44;product=hypothetical protein;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator;translation=MNLRKIVLDYLDGKVGTVAPNRIRRRFNTYIPHQKITTDTTEFKYYEINANDVTYYSYDELK;locus_tag=LOCUS_0430;note=WP_153495214.1 IS3 family transposase (Lactococcus hircilactis) [pid:82.9%25%2C q_cov:56.5%25%2C s_cov:7.7%25%2C Eval:1.1e-10%2C partial hit],internal stop codon at [32091:32093](-),frameshifted%2C insertion/deletion at around 32042,MGA_44 sequence1 MetaGeneAnnotator CDS 32382 33758 . - 0 ID=MGA_45;product=IS3 family transposase;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_209421102.1;translation=MKYDYVFKLNAVELYRSGQWIETPEGISQKDFRKRIVQWSRIADIYGLDSLRHSTTCKERSAECRYQLVARVLAGESQKSVAISAGIDSGLLSKWVQTYKIKGYEGLNLKKGRKSKKEANVSKKSKPTDLTPSEREELIRLRAETEYLKTENEAIKKINRLETRKMGCGTQGEKAAIIKELREKGYQLKYLLKATGVSKSTYYFEINKSDVVADRNEELLIVIREIFEKNKHRYGVRRIYHELLNRGYHINHKRVQRLMHEAELAGKRPKEKYHSYKGEVGKIADNVINRDFSTTAPLQKWTTDVSQFNFSWGKCYISPVLDMNTNEIISYDLSKSPNLKQIERMLDKAFDKFPSVEGLVFHSDQGWQYMHAYFRNTLKERGIIQSMSRKGNCYDNCIMETFFGRLKNEMYYGYEKDYSSFEEFSKAVEEYIDYYNNKRIQAKTKWMPPVKYRIASMC;locus_tag=LOCUS_0440;note=WP_209421102.1 IS3 family transposase (Fusobacterium hwasookii) [pid:47.8%25%2C q_cov:90.0%25%2C s_cov:89.4%25%2C Eval:2.0e-97],MGA_45 sequence1 MetaGeneAnnotator CDS 33931 34116 . - 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prediction:MetaGeneAnnotator;translation=MFGKKNKAEEKIIADICEILKDPNLKSEERDALIRVKNRLEKGEYTQRVLNNFLSQVRPLALQSKLSPSVDKFYTDIINNAYKGISWAGMMFMKF;locus_tag=LOCUS_1240;note=MGA_125 sequence1 MetaGeneAnnotator CDS 116491 116751 . - 0 ID=MGA_126;product=hypothetical protein;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator;translation=MVGMSYAKKIIKWILSLLLIIIVGITIITVYSAYYSFGTMIFGVHTESAIKDFWSTEFLLGVVYIIVVITIAVITEVTRLYKKHLK;locus_tag=LOCUS_1250;note=MGA_126 sequence1 MetaGeneAnnotator CDS 117026 117937 . - 0 ID=MGA_127;product=prolyl aminopeptidase;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA 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DNA-binding protein (Lactobacillus acidophilus) [pid:65.1%25%2C q_cov:100.0%25%2C s_cov:100.0%25%2C Eval:9.8e-54],MGA_149 sequence1 MetaGeneAnnotator CDS 142929 143165 . + 0 ID=MGA_150;product=30S ribosomal protein S18;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_003701427.1;translation=MVQQRRTTHRRRKVDFISANHIDYIDYKDVDLLKRFISERGKILPRRVTGTSAKNQRMLTVAIKRARVMGLLPFVSED;locus_tag=LOCUS_1490;gene=rpsR;note=WP_003701427.1 30S ribosomal protein S18 (Ligilactobacillus) [pid:84.6%25%2C q_cov:100.0%25%2C s_cov:100.0%25%2C Eval:8.1e-32],MGA_150 sequence1 MetaGeneAnnotator CDS 143333 145348 . + 0 ID=MGA_151;product=DHH family phosphoesterase;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA 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(Lactobacillus helveticus) [pid:69.0%25%2C q_cov:98.4%25%2C s_cov:98.0%25%2C Eval:1.0e-304],MGA_261 sequence2 MetaGeneAnnotator CDS 69412 70254 . + 0 ID=MGA_262;product=type I pantothenate kinase;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_003550009.1;translation=MEEDYIKITPEMWRHCVSPGANSLDFLILLIEKSYTNYLNKQKNNLQFVTKSIVNPPFVVAVTGSVASGKSTLSKKLKLALQEKYGNDNVDLVSMDGFIMSNAELDDKGLMSQKGFPSSFKWDAIVNFLTEIKRRRPKVPYRLYSQTISDLVPDKIAYVKQPDILLVEGINLLQTYGKQKVLTDFIDFSIYLDADESLLESWFMDRFHQLLVVNANSPDNFFYRWVKMPTAEADRLAHQVWRDVNLKNLHEYILPSKERADLIVKKCRDHIMTDFYIKKY;locus_tag=LOCUS_2610;gene=coaA;EC_number=2.7.1.33;note=WP_003550009.1 type I pantothenate kinase (Lactobacillus acidophilus) [pid:41.5%25%2C q_cov:90.0%25%2C s_cov:83.2%25%2C Eval:1.4e-54],MGA_262 sequence2 MetaGeneAnnotator CDS 70267 70827 . + 0 ID=MGA_263;product=elongation factor P;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_003550017.1;translation=MTTAIELKKGMIFKQDGKLIEVLVSNHHKPGKGNTVMQMDLRDVMSGSVVHKTMRPSEKVELVHVDLKKAQYLYDDEVNFIFMDTATYEQYEIPKEHLSEESKYLLPNINVDLKFTDEGQLIGVGLPTTVNMKVVETQPGIKGATAASGGKPATMETGLVVTVPDFINEGDELIINTDTGEYKSRA;locus_tag=LOCUS_2620;gene=efp;note=WP_003550017.1 elongation factor P (Lactobacillus acidophilus) [pid:69.4%25%2C q_cov:100.0%25%2C s_cov:97.4%25%2C Eval:7.6e-72],MGA_263 sequence2 MetaGeneAnnotator CDS 70984 72264 . + 0 ID=MGA_264;product=peptidase T;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_003548288.1;translation=MNDIDTAYIEQKFVEYCKVNTRSDPNNNCVPTTKGQVELLMIIKNELQELGLKNISYSAKDSYLVGLLPSNTATLTTAVGFVAHVDTADYNAENVKPQIYRNYDGKKIYLDPQKDRVLDPAEFPSLKKHIGETLITASGSTLLGADDKAGIAGLLGMLKYFKNHPNAEHGDIWVAFGPDEEIGQGAKRFDISRFPVEFAYTLDNGDPGDIAYETFNAASATLQFKGTIVHPGEAYGLMVNATTMASEFIESLPKDQVPEKSKDFEGFMMVLSNSGDVGYAKVELIIRDFDTASFLAKKKMLIDLVDAFNKKYGENRVEISMHDQYKSPGDLIKQYPYVVNLVLHAYEKMGLVPKIIPFRGGTDGDFISEKGIPTPNLFNGGANFHGPYEYVSVESMSLLSKTLITIVQLHLKMCDHRDNTPLKRKY;locus_tag=LOCUS_2630;gene=pepT;EC_number=3.4.11.4;note=WP_003548288.1 peptidase T (Lactobacillus acidophilus) [pid:54.4%25%2C q_cov:98.1%25%2C s_cov:98.1%25%2C Eval:2.3e-129],MGA_264 sequence2 MetaGeneAnnotator CDS 72284 73195 . + 0 ID=MGA_265;product=DNA/RNA non-specific endonuclease;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_003550055.1;translation=MARRKKPQKRNDLSRSIFWLICIILAFTFWGTKRSAYHTHTDNYRTQFNKQVPSSSHRDNSPKINATSEIPAAKIAKSAYGGLDDSDYQKLAACNFKSGDAAYVYVNNNHSTLIKNAWKINKVIYSNLDSLNRTSHSNTAFLESRNVANDSLRVRQFINPTGWHSNRQNAMRTQIYNRGHMIAYSVSAGIDQSGRYNPNNQSGDQNNIKNLFTQTAFSNQKIQTIFESKVRKALRMGQKVIFQATPIFRGNELMARGINLQAISVNGWLDFNVYIFNVQPGYTFDYATGRAKVARDFSVGWVK;locus_tag=LOCUS_2640;note=WP_003550055.1 DNA/RNA non-specific endonuclease (Lactobacillus acidophilus) [pid:62.5%25%2C q_cov:98.7%25%2C s_cov:98.9%25%2C Eval:1.2e-96],MGA_265 sequence2 MetaGeneAnnotator CDS 73259 74176 . - 0 ID=MGA_266;product=BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_003548278.1;translation=MFKYMIGIDAGGTHSTAIAYDEQGKELGRAESGPGQINNDYNLGIKNITVAINELRNKIDGDCIKILAGIAGLSVVGNAPEVAATISSMVGNIPTRAITDSLLALYNGLEGTDGALVIAGTGSVVNGRQNGSLITVGGYGSLLGDEGSGYAITKAALVTALSKWDQRQPSSLIDLFIKIWNLDNMNDAPAKFYTMTSPQVASYAVEIAKLADSGDAEARDIIQEQAHLLARDILMCLDRYQEPKPMRIALTGSVLSNNAMIRSFMEDEVKEQYPDAVFSVSNGENARGVIYDKSKDYRYFTSSKN;locus_tag=LOCUS_2650;note=WP_003548278.1 BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein (Lactobacillus acidophilus) [pid:70.3%25%2C q_cov:99.3%25%2C s_cov:98.7%25%2C Eval:4.6e-123],MGA_266 sequence2 MetaGeneAnnotator CDS 74349 75257 . + 0 ID=MGA_267;product=hypothetical protein;inference=COORDINATES:ab initio 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sequence:RefSeq:WP_003549970.1;translation=MMKDNRKFSVVIAGGGSTFTPGFVLNLLKNQDRFPLRKIKFYDNDAERQKKIGDAVSIIMNERAPEIEFEYTTDPKEAFTDVDFVMGSIRVGKYHMRSLDEKIPLRYGVNGQETTGPGGMAYGLRSIPAIIQIIDWMEEYSPNAWMINYSNTIAIVAEACRRLRPHSKVINICDMPIDIMTRMAQICGLKDYHDLDFNYYGLNHFGWWKGVWDKKTGKDLMPELKKYVSKNGYWVGGDFDKNTEASWKETFKKAADCYALEPNTLPNTYMQYYYYPQYEVKNADPNRTRTDEIREYRQKIVFGECERIVKEGTAENNMWDRNETHSEYIVDICHAIAYNTGEKFLANIPNNGAISNMDPDSIVEVPCLFTSHGVEPISTGEAGIFQRGLMMEQQTCEKLVVDAYEQHSYEKMWEAFALNKTVPDALVAKKILDDMIPENKPYWPILK;locus_tag=LOCUS_2720;note=WP_003549970.1 maltose-6'-phosphate glucosidase (Lactobacillus acidophilus) [pid:78.4%25%2C q_cov:99.3%25%2C s_cov:99.8%25%2C Eval:2.3e-212],MGA_273 sequence2 MetaGeneAnnotator CDS 81569 83191 . + 0 ID=MGA_274;product=alpha-glucoside-specific PTS transporter subunit IIBC;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA 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(Lactiplantibacillus plantarum) [pid:28.7%25%2C q_cov:77.4%25%2C s_cov:75.5%25%2C Eval:3.5e-19],MGA_289 sequence3 MetaGeneAnnotator CDS 4500 5390 . - 0 ID=MGA_290;product=ATP-binding cassette domain-containing protein;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA sequence:RefSeq:WP_002287087.1;translation=MLDVKNINIYYGHKEIIRDASFTISSGEIVGLIGPNGAGKTTIMKTLLGLTHFTGKLSFNGQPITLKDHAALQTVGALIENPAIYPFLTGRDNLKLYSQDSTDTAKLITRLGMDGYIDRKAKDYSVGMKQKLGIALALLNNPKLVILDEPMNGLDIEATISIRKLIHEYAAQGTAFLISSHVLSELQKVMTSVIIINHGKITMNSPMSRFTQEISSESKLQTTAMKQTTELLQQAKISFNQKGDYLIVNQENIATIQQLLFENKIWINYLAPAGLTFEQKIINVLQTKQGGDNNEN;locus_tag=LOCUS_2890;note=WP_002287087.1 ATP-binding cassette domain-containing protein (Enterococcus) [pid:45.2%25%2C q_cov:97.6%25%2C s_cov:97.7%25%2C Eval:3.9e-63],MGA_290 sequence3 MetaGeneAnnotator CDS 5392 8061 . - 0 ID=MGA_291;product=class III lanthionine synthetase LanKC;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA 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lanthionine synthetase LanKC (Niallia taxi) [pid:31.6%25%2C q_cov:98.2%25%2C s_cov:97.3%25%2C Eval:4.2e-108],MGA_291 sequence3 MetaGeneAnnotator CDS 8753 9517 . + 0 ID=MGA_292;product=hypothetical protein;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator;translation=MHFTQFLNEFEGINVYYSTVYQLLSQAEVDSPKIQKATRGDRTKAKYRLKHPEAAKTETEQAADLSLVHKYVSSILGTYHIDNATGVIVDAWFAWQETLEGYYHVFYQILENYGIPYRFKTDNRTVFNYNSSNKKDDTMDVLTRLGYACKQLGTEIVITSVSQVKGMVERANQTFQGRLKQEFRIAQINDIETANDYLLNTFVPDFNENNNLVCFNNHTKCLVIEAFDKQRFITVDDEIYFMREIPKNVKYSPD;locus_tag=LOCUS_2910;note=WP_153437736.1 ISNCY family transposase (Sinorhizobium terangae) [pid:39.0%25%2C q_cov:46.5%25%2C s_cov:24.6%25%2C Eval:4.0e-15%2C partial hit],MGA_292 sequence3 MetaGeneAnnotator CDS 9753 10268 . - 0 ID=MGA_293;product=O-acetyl-ADP-ribose deacetylase;inference=COORDINATES:ab initio prediction:MetaGeneAnnotator,similar to AA 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